Ville relais, Parakou est le terminus de la voie ferrée en provenance de Cotonou. Elle constitue un important carrefour des grands axes routiers (Bénin-Niger, Bénin-Togo, Bénin­Bourkina-Faso, Bénin-Nigéria).

Plus de la moitié du parc automobile ‘’gros porteurs’’ du Bénin se retrouve à Parakou, ce qui fait dire que la ville est la capitale des gros porteurs. Mais il existe également d’autres moyens de déplacement.

- les deux roues : environ 3 223 et communément appelés «Zém», les conducteurs de taxi motos jouent un grand rôle dans la mobilité urbaine ; les plus grands utilisateurs de ce mode de déplacement sont les femmes (pour leurs menues courses en ville), les élèves (pour se rendre à l’école). Les conducteurs des taxi-moto sont regroupés au sein de 5 syndicats pour la défense de leurs intérêts : ACVR-Z (1428 conducteurs), SYNCOTAMOB (746), SJCP (260), AZDP (336), AZAP (453)

-          les taxis inter urbains : ils assurent le transport des personnes entre Parakou et les autres localités du Bénin. Les principales destinations desservies sont : Cotonou, Natitingou, Malanville(vers le Niger), Kabo (vers le Nigeria), Banikoara (vers le Burkina Faso), Porga.

Ils occupent 5 gares routières ou parcs : Parc A : gare centrale face à l’hôtel de ville ; Parc B : auto gare de Tchatchou; Parc C : auto gare de Guinnan; Parc D : auto gare de Kabo; Parc E : auto gare de Sonagri

Les conducteurs de taxi sont affiliés aux 2 organisations syndicales existant dans le secteur des transports (UNACOB, UCTIB, etc.).

-          les taxis ville : il ne s’agit pas de taxi ville proprement parlant, ces taxis assurent plutôt le transport des commerçantes et des marchandises entre Parakou et les marchés des localités environnants (Komiguéa, Boko, Kpètèkpètèrou, Bakpérou, Tourou, etc) ;